iTRAQ、SILAC和SWATH等相比,我更应该选择哪一种定量的方法呢?itraq和laber free的区别

iTRAQ、SILAC和SWATH等相比,我更应该选择哪1种定量的方法呢?



1、iTRAQ、SILAC和SWATH等相比,我更应该选择哪1种定量的方法呢?

目前主流的定量蛋白质组方法有5种,分别是iTRAQ、SILAC、MRM(MRMHR)、label-free和SWATH 。其中最流行的是iTRAQ定量蛋白质组方法,该方法不依赖样本,可以做任意样本的总蛋白质的差异定量,而且定量准确,这个层次上label-free虽然也可以做任意样本,但是定量准确度难以保障。SILAC是仅仅适合细胞层次的蛋白质组定量,组织的定量需要摸索或者前人已经摸索的模式,中途测试新组织难度较大,极易失败,细胞层次的SILAC培养费用高昂,不适合做商业化。MRM和SWATH都是目标蛋白质组相关的定量模式,但是SWATH可以完成数千种蛋白的定量,准确度极高,通量远高于MRM,对于亚细胞结构、细菌、真菌、细胞分泌物等样本,SWATH效果非常好,当然,SWATH价格相对较高。SWATH本身对物种没有偏向性,也是目标蛋白定量的1种,定量结果准确,可以和MRM媲美,发文章更具有说服力,但是1次能定量只能达到2000多个蛋白。



2、itraq和laber free的区别

目前主流的定量蛋白质组方法有5种,分别是iTRAQ、SILAC、MRM(MRMHR)、label-free和SWATH 。其中最流行的是iTRAQ定量蛋白质组方法,该方法不依赖样本,可以做任意样本的总蛋白质的差异定量,而且定量准确,这个层次上label-free虽然也可以做任意样本,但是定量准确度难以保障。SILAC是仅仅适合细胞层次的蛋白质组定量,组织的定量需要摸索或者前人已经摸索的模式,中途测试新组织难度较大,极易失败,细胞层次的SILAC培养费用高昂,不适合做商业化。MRM和SWATH都是目标蛋白质组相关的定量模式,但是SWATH可以完成数千种蛋白的定量,准确度极高,通量远高于MRM,对于亚细胞结构、细菌、真菌、细胞分泌物等样本,SWATH效果非常好,当然,SWATH价格相对较高。SWATH本身对物种没有偏向性,也是目标蛋白定量的1种,定量结果准确,可以和MRM媲美,发文章更具有说服力,但是1次能定量只能达到2000多个蛋白。



3、itraq和laber free的区别

目前主流的定量蛋白质组方法有5种,分别是iTRAQ、SILAC、MRM(MRMHR)、label-free和SWATH 。其中最流行的是iTRAQ定量蛋白质组方法,该方法不依赖样本,可以做任意样本的总蛋白质的差异定量,而且定量准确,这个层次上label-free虽然也可以做任意样本,但是定量准确度难以保障。SILAC是仅仅适合细胞层次的蛋白质组定量,组织的定量需要摸索或者前人已经摸索的模式,中途测试新组织难度较大,极易失败,细胞层次的SILAC培养费用高昂,不适合做商业化。MRM和SWATH都是目标蛋白质组相关的定量模式,但是SWATH可以完成数千种蛋白的定量,准确度极高,通量远高于MRM,对于亚细胞结构、细菌、真菌、细胞分泌物等样本,SWATH效果非常好,当然,SWATH价格相对较高。SWATH本身对物种没有偏向性,也是目标蛋白定量的1种,定量结果准确,可以和MRM媲美,发文章更具有说服力,但是1次能定量只能达到2000多个蛋白。



4、itraq技术服务哪家公司做的好?(价格、周期)

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